细菌肥料检测（微生物肥料检测）是对含有特定微生物活体的肥料制品进行的有效活菌数、杂菌率及安全性评价。微生物肥料通过微生物的固氮、解磷、解钾及产生植物激素等作用，改善土壤养分供应和植物生长条件。检测核心在于有效活菌数的准确计数和菌种纯度鉴定。
检测项目
有效活菌数：目标功能菌的CFU计数（平板计数法或MPN法）。
杂菌率：非目标菌占总菌数的比例。
菌种鉴定：形态学、生理生化特性及分子生物学鉴定（16S rDNA）。
水分、细度、pH值。
重金属：砷、镉、铅、铬、汞。
大肠菌群数、蛔虫卵死亡率。
保质期验证：储存期活菌数衰减评价。
检测样品
根瘤菌肥料：豆科作物接种剂。
固氮菌肥料：自生及联合固氮菌剂。
磷细菌肥料：解磷、溶磷菌剂。
钾细菌肥料：解钾菌剂（硅酸盐细菌）。
复合微生物肥料：含两种以上功能菌。
生物有机肥：功能菌+有机物料。
样品要求：不少于500g；样品应冷藏运输（2~8℃）；注明产品名称、标称菌种、有效活菌数、生产日期及保质期。
测试周期
有效活菌数培养计数：7-10个工作日（需培养周期）
菌种鉴定：5-10个工作日
全套检测：10-15个工作日
注：周期从样品到达且资料齐全之日起计算，具体以实际项目为准。
检测标准
1、NY/T 798 复合微生物肥料
2、NY 884 生物有机肥
3、GB 20287 农用微生物菌剂
4、NY/T 227 微生物肥料
5、NY/T 2321 微生物肥料产品检验规程
6、NY/T 1535 肥料合理使用准则 微生物肥料